《祝由科》是海内外罕见的手稿，据说出自道士张樽之手。它又称《秘诀奇书》，共五册，未编序号，分别被命名为：乾、元、亨、利、贞。从乾册首页的注解可知，《祝由科》原石碑文于康熙十三年（1656 年）作为十三科之一被皇家收藏馆收藏。祝由科是“13 科“中的第 13 科。此书可能是清初之前刊发的。乾册中有关于其来源的叙述：宋朝淳熙二十八年（1188 年），巡抚雅奇奉命治理黄河，在那里他掘出 58 块刻有密文的石碑。后来，张樽译出碑文，自此以后疾病治疗“其应如响”。

相传明朝景泰年间（1450-56 年），山东临清县的医者徐景辉掌握了这种疗法，以此济世，患者纷纷求访，家中门庭若市。张樽在乾册的附言中写道该书还有一种次等版本。次等版本见于 1724 年，由沈长发手抄整理，但是五册之间内容不连贯，祝由之法和禁忌形式也大相径庭，因此推测该版本是藏书者将来源不同的版本摹写之后，集为一贴。使用祝由之法治病是普遍被人接受和尊重的行业。祝由师使用禁法、咒法、祝法、符法“以气封疡而徙之”。这些方法不但能够治疗疾病、缓解痛苦，而且 能够制止婴儿夜间啼哭、帮助妇女分娩以及治疗虫兽咬伤，还能“满水招财”、“神符绝鼠”以及“吹毛为虎”等。书中的疗法对成年人和儿童均适用。《祝由科》 将医疗分为大方脉科、产科、眼科、风科、口齿咽喉科、耳鼻科、外科、伤折科、疮肿科、金簇科和书禁科等。

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